生理期头疼的原因大致包括以下几方面：

1.女性生理期时由于激素水平变化，导致女性情绪受到一定的影响，可以表现出急躁、焦虑不安等，会干扰到正常的大脑神经功能，睡眠结构异常可表现出头疼不适。

2.女性生理期阶段处于失血状态，身体比较虚弱，机体免疫力低下，大脑神经较敏感，容易因环境因素、饮食因素等多方面干扰而出现头疼症状。

3.女性生理期阶段，由于痛经或者经血量较多等引起身体不适，干扰大脑神经功能可表现出头疼的症状。