长效干扰素和普通干扰素的主要区别就是药物的作用时间长短。长效干扰素药效要持久，短效干扰素药效很短的。但是长效干扰素价格很昂贵，这也是很多患者很困扰的。聚乙二醇干扰素是一种长效干扰素,其机制在于在干扰素分子上交联了一个无活性、无毒性的聚乙二醇分子,从而延缓了千扰素注射以后吸收和清除的速度,使其半衰期延长。长效干扰素一般一个星期只需注射一次，而普通干扰素一个星期就要注射3次。它们的区别主要在于：普通干扰素注射后，大部分经过肾脏漏出体外，注射后4个小时就排出一半，12个小时后体内的干扰素基本完全排出体外，而长效的干扰素，克服了这一缺点。所以普通干扰素不仅使用不方便，而且抑制病毒也不持久，而长效干扰素，药效持续时间较长。不管是长效干扰素还是普通干扰素治疗，乙肝丙肝都是有一定的适应性不要盲目用药治疗。然而,即使是采用这种方案血药浓度波动仍很大,造成药物浓度出现高峰与低谷。血药浓度处于峰值时,干扰素相关不良反应,如流感样症状的发生率增高,这会影响药物的耐受性。相反,当血药浓度处于谷值时,血液循环中没有干扰素,因此不能持续抑制病毒。此时可能出现病毒量反跳。长效干扰素,克服了普通干扰素半衰期短的缺点。能够持续抑制病毒,1次注射后有效血浓度可维持7天。每周1次的注射剂型中有最高水平的抗病毒活性和安全性,将与长半衰期药物和药物蓄积有关的风险降到最低。最好在医生指导下安全用药。