骨关节一般是通过外伤被结核菌所感染，比如身体某些部位出现了外伤，在这种情况下如果接触了携带结核杆菌的动物，就容易感染到结核菌。

还可能是由于得了肠结核或肺结核，致使结核杆菌通过原发性病灶逐渐产生细菌栓子，而这些细菌栓子会通过血液循环，逐渐渗入到骨关节血运比较丰富的部位，比如脊椎部位、长骨的干骺端等。

此外，也有少数患者并不存在原发病灶，而是直接受到结核杆菌感染，直接进入到脊椎或骨关节等部位，致使骨关节结核形成。