慢性非细菌性前列腺炎主要是以药物治疗为主。

在确定致病菌的类型后，可使用头孢菌素类或喹诺酮类的抗生素进行治疗，在用药2~4周以后，临床症状可能会逐渐缓解。如果症状仍然存在，还应继续服用抗菌药物进行治疗。

如果慢性非细菌性前列腺炎所引起的疼痛比较严重，还可口服抗炎镇痛类药物缓解，比如布洛芬、双氯芬酸钠等。可配合使用物理疗法辅助治疗，比如前列腺按摩、热疗、生物反馈治疗等。在日常患者也要多注意休息，减少性生活次数，避免久坐。