导致附睾炎发作的细菌一般是从下尿路感染继发，常见的细菌是大肠埃希菌、变形杆菌、链球菌，葡萄球菌和淋病奈瑟菌等，此外沙眼衣原体也可以导致急性附睾炎发作。

所以针对附睾炎治疗的抗生素，首先应选用广谱的抗生素，如头孢菌素类，喹诺酮类等，在治疗的同时可以行细菌培养，针对培养的细菌，做药物敏感实验，然后再根据结果选择敏感性的抗生素对症治疗。

对于衣原体感染所导致的附睾炎，可以应用大环内酯类的抗生素，比如阿奇霉素等等，并且可以联合应用糖皮质激素治疗，治疗的时间一般比较长。