HPV疫苗的种类有三种，目前国际上和国内疫苗的种类基本相同，包括三种亚型，一个是二价，一个是四价和九价。二价HPv疫苗是含有HPV16和HPV18亚型的疫苗，这两种属于高危型病毒，它们对宫颈癌的发生有直接作用。

而四价HPV疫苗是在二价的基础上增加了HPV6和HPV11亚型的疫苗，这两种亚型是属于低危型感染的亚型，它们会导致发生一些尖锐湿疣和皮肤病性的病毒。注射四价疫苗，对宫颈癌以及这两项疾病的预防有一定作用。

而九价宫颈癌疫苗在此基础上，增加了HPV 31型、 HPV 33 型、HPV 45 型、HPV 52型和HPV 58型，这5种其他高危型亚型的病毒，属于目前涵盖病毒量最广的疫苗。