支原体衣原体阳性是否严重，一般和患者的临床症状有关。

例如泌尿系统支原体、衣原体感染，引起人出现尿频尿急现象是不严重，在医师指导下服用阿奇霉素、红霉素等药物治疗即可康复。

如果泌尿系统支原体、衣原体阳性，引起了肾炎、肾囊肿比较严重，此时通常会伴随着面部浮肿和尿少、血压升高现象。若不及时治疗会导致肾功能下降，影响肾脏对尿液的正常过滤与重吸收功能。若不及时治疗，容易诱发肾性高血压或者慢性肾功能衰竭、尿毒症。