葡萄球菌感染的肺炎通常不可以自愈。因为肺部一旦被细菌感染，通常是由于身体抵抗力较弱引起的，这时自愈的几率比较低，不建议等待自愈，避免导致病情加重，对身体造成更大危害。

如果肺部被葡萄球菌感染，建议及时进行抗感染治疗，可以在专业人员的指导下，使用头孢类抗生素，配合止咳化痰的药物进行治疗。如果有发烧症状伴随，还需要使用退烧药物进行治疗。

另外，如果是因为金黄色葡萄球菌引起的肺炎，治疗的过程通常需要延长，可以使用敏感的抗生素进行治疗，大约经过6~8周的治疗疾病可以逐渐痊愈。