长时间缺钙有可能会引起腰痛症状，但是一般短时间的缺钙并不会明显引起腰痛症状。如果长时间缺钙会引起骨质代谢异常，导致骨的矿化异常，出现骨密度减低、骨量丢失的情况。

如果腰椎出现了大量的骨量丢失，就会出现疼痛症状。再有，如果长时间缺钙会引起腰椎退变，从而会导致脊柱不稳，在活动以后会造成周围稳定结构，肌肉、韧带、筋膜等产生劳损和损伤，从而产生疼痛。

如果长时间缺钙，还容易引起神经肌肉功能紊乱，导致相应的疼痛症状。短时间缺钙，通过内分泌的调节，一般不会明显影响身体的正常功能。