慢性结肠炎会引起直肠黏膜充血。此病最主要的症状是腹泻，而且腹泻程度不一，轻者一天排便3～4次，或腹泻与便秘交替发生，重者可每1～2小时排便一次。

当直肠受到严重影响时，粪便大多是糊状的，混合着很多黏液，甚至还有脓，有时伴有发热、恶心、腹胀、厌食等症状，腹痛可能位于脐周围或右上腹。

长期患病的患者会出现体重减轻、贫血、面色苍白等症状，有的患者会出现急腹症。慢性结肠炎的诊断主要依靠结肠镜检查，可进行病理组织活检。