婴儿腹泻、发烧可能是存在细菌感染，应当及时到医院查大便和血常规，并在医生的指导下使用抗生素类药物进行治疗，比如阿莫西林克拉维酸钾类抗生素。

当婴儿的体温超过38.5℃时，还应及时地给小儿口服退烧药物，比如布洛芬混悬液，能够降低体温，避免婴儿出现高热惊厥。还可配合使用益生菌、肠道黏膜保护剂等药物进行治疗。

在治疗的过程当中也要注意婴儿体液的补充，防止婴儿出现脱水或水电解质紊乱，加强身体保暖。在症状消失以后应就医进行复查，明确感染是否已消除。