长期肛门疼痛可由痔疮引起。

患了炎性外痔、血栓性外痔，外痔处会出现肿胀和疼痛；内痔脱出肛门外，难以还纳肛门内，脱出痔核会出现疼痛；患了肛裂，排便时和排便后裂口内的末梢神经受到刺激，会出现剧烈疼痛，疼痛呈周期性间歇性反复发作；患了肛瘘，外口会不断流出脓液，有时外口闭合，外口处会出现红肿和疼痛；患了肛窦炎，肛窦处会出现红肿，引起肛门内刺痛，伴有肛门坠胀感。

这些疾病有的需要对症治疗，有的需要手术治疗，治愈了这些疾病，肛门疼痛会缓解和消失。