直肠感染了HPV以后规范系统的治疗，一般三周到一个月能好。直肠感染了HPV以后，会有尖锐湿疣疣体的生长，在出现疣体后，及时地通过冷冻等方法进行去除，同时也要合理地使用抗病毒的药物，预防复发的情况。

直肠尖锐湿疣病毒在疣体去除之后，也要注意加强肛门局部的换药，防止出现伤口的细菌感染。伤口完全恢复的时间要在三周到一个月左右，一般属于电烧灼伤，或者是通过冷冻的方式祛除伤口。

另外，患者还有复发的可能性，有一部分患者如果出现了新的疣体生长，需要再次通过烧灼或者是冷冻的方法去除。总的治疗周期可能会在一个月左右，另外完全消失观察周期在两年左右。