双侧输卵管堵塞后一般不能自然怀孕。

因为输卵管具有输送卵子和精子，以及受精卵的功能，如果发生堵塞精子无法进入输卵管内与卵子相遇，无法结合成受精卵。即使结合成受精卵也无法进入子宫腔，容易发生不孕症。

所以，对于两侧输卵管堵塞的女性，需要进行辅助的生育技术。临床上常用的是胚胎移植，将精子和卵子在体外受精后移植到女性的宫腔内，才能使受精卵发育成胎儿。如果女性患有双侧输卵管堵塞，可以到医院咨询医生。