克罗恩病的诊断，需要根据患者的疾病临床表现以及相关的辅助检查结果来判定，同时也需要详细询问该疾病的病史。

如果该疾病的消化症状较为明显，有明显的腹胀、腹痛以及恶心、呕吐、便血等症状。同时到医院就诊做小肠钡餐造影时，小肠壁的慢性炎症呈跳跃性以及阶段性分布时，要考虑有克罗恩病的可能。也可以做消化道的内镜检查，观察胃、食管以及十二指肠等部位的黏膜情况。

该疾病如果不及时地治疗，有可能会形成瘘管，并且有可能会出现消化道出血、肠穿孔以及癌变。