右心房肥大可能是由于右心房的负荷增加引起，所以，要治疗右心房肥大，要找到能够引起右心房肥大的原发因素，做针对性治疗，才能达到治疗的目的。

右心房肥大可能的原因有三尖瓣的狭窄，或三尖瓣反流，也可见于肺动脉高压。三尖瓣狭窄或者三尖瓣反流的最常见原因，是风湿性心脏瓣膜病，也可能是先天畸形，对于这种情况，只能通过手术方式治疗。

如果是肺动脉高压，可以选择治疗肺动脉高压的药物，比如伊洛前列腺素、波生坦等，必要时也可以通过手术治疗。在右心房负荷降低后，右心房肥大就可以慢慢改善。