生殖器表面长疱疹能否根治，需要依据疾病的种类确定。

生殖器上长疱疹，如果是单纯疱疹二型病毒感染之后引发的生殖器疱疹，以目前的医学发展程度，没有办法根治。这种情况一旦免疫力降低就会反复发作，因为病毒会潜藏在脊神经根内部，伺机而动。

如果生殖器表面长得疱疹，是由于水痘-带状疱疹病毒感染之后，引发的生殖器带状疱疹，在选择抗病毒类药物治疗一段时间之后能够根除。但是，有时治疗不及时，可能会残留后遗神经痛，所以要有心理准备，发现症状，及时治疗。