药物流产后是会引起月经失调的，因为流产的药物是影响内分泌的。流产药主要是对抗体内的孕激素，可以抑制排卵，所以吃完流产药以后，会引起短时间的月经不正常。

一般情况下，过2-3个月以后，等到药物排泄干净，月经就能够恢复正常。如果出现了长时间的月经失调，必须要进一步的查明原因后，进行治疗。可以在来月经的第三天抽血，查性激素6项和甲状腺激素，主要是看一下内分泌是否正常。

药物流产由于出血时间比较长，有可能造成子宫内膜炎，会引起宫腔粘连和子宫内膜损伤。如果是药物流产后，出现月经量减少或者是不来月经，最好做一下宫腔镜的检查。