小儿心肌炎的临床表现轻重不一，取决于年龄和感染的急性或慢性过程，预后大多良好。

少数重症患儿可留下心律失常的后遗症，心律失常可以有多种表现，如房性早搏、交界性早搏、室性早搏、阵发性室上性心动过速、室性心动过速、房室传导阻滞等都有可能出现，与受损害的心肌部位以及损害的严重程度有关。

慢性心肌炎患儿，可以变成扩张性心肌病，导致心脏增大，起初时可以没有临床症状，随着年龄增长，可能会出现心力衰竭、气喘、乏力、水肿等症状。