女生阴蒂肥大乳腺萎缩的原因，可能是激素水平异常导致的。根本的原因是体内雄激素增多了，比如患有一些疾病前列腺肾上腺皮质增生症、男性化肾上腺肿瘤、两性母细胞瘤、卵巢睾丸母细胞瘤等。

染色体异常方面的疾病，比如真两性畸形等。需要进行相应的体格检查，以及实验室检查来测定激素的水平，进行初步的判断。还需要进行性染色体的检查，采用组织病理检查，可以用于肿瘤的鉴别诊断。

如果是真两性畸形的患者，采用腹腔镜的检查，对于诊断具有很重要的意义。确诊疾病以后采取相应的治疗措施。