怀孕6个月肚子有点疼的原因有：

1.当出现晚期流产时，最开始会表现肚子一阵一阵胀痛，这种情况需要及时保胎处理。

2.当孕妇出现胃肠功能紊乱时，胃肠痉挛也可以出现肚子疼痛。

3.当孕期出现肾结石、泌尿系统感染等情况，也会出现肚子不适，一般这种情况需要到医院行进一步检查后，再予以对症处理。

4.孕期合并其他疾病，比如早期阑尾炎、附件包块、妊娠合并子宫肌瘤等，都可以出现肚子痛。这种情况需要早期处理，避免病情加重，对胎儿或孕妇造成不良影响。因此，对于怀孕6个月肚子有点疼，需要及时到医院检查及处理会更安全。