宫外孕常见的病因，位于第一位的就是输卵管炎症和附件区的炎症，其次输卵管发育畸形、输卵管具有手术史都是宫外孕的原因。包括一部分女性输卵管先天发育畸形、输卵管过长以及输卵管的基层功能能力差，输卵管内的纤毛缺乏或运动不良也是输卵管宫外孕的发生原因。

目前临床上还有一部分发病率较高的原因，就是辅助生殖技术，是将受精卵在体外培育孕囊形成之后放入宫腔之内，有可能会引起受精卵着床位置错误，比如着床到宫颈，也是属于宫外孕的病因之一。

服用口服紧急避孕药之后，宫外孕发病率也会增加。