肺炎衣原体感染后总是反复一方面考虑治疗不彻底，另一方面与患者机体抵抗力差、营养不良等因素相关。

衣原体感染后引起的肺炎治疗疗程通常为2-3周，如果抗生素使用不当或者治疗疗程不够，就可以引起衣原体感染的反复发作。因此，一旦确诊衣原体感染后必须给予足疗程治疗，常用的药物以大环内酯类药物为主，如阿奇霉素、红霉素、罗红霉素等。

同时应该积极参加体育锻炼，适当补充营养，增加机体抵抗力，也能在很大程度上减少衣原体感染的反复发作。