宝宝秋季腹泻好了又出现咳嗽的现象，有可能是在腹泻期间机体抵抗力下降，受凉后引起的感冒，进而导致出现阵发性的咳嗽。

如果咳嗽症状比较轻微，可以使用对症止咳的药物进行治疗，比如小儿氨溴索口服液、小儿急支糖浆等，需要根据宝宝不同年龄阶段，遵医嘱服用药物。如果宝宝咳嗽症状比较严重，甚至出现发热、恶心、呕吐等，有可能是秋季腹泻之后继发细菌感染引起，需要化验血常规C-反应蛋白等，必要时行X线胸片检查明确是否有肺部感染，然后在医生的指导下服用抗生素类药物积极抗感染治疗。

同时还要做好胃肠道护理，比如可以给予腹部推拿、按摩、艾灸等，避免腹泻症状出现反复。