三个月宝宝食欲差，首先可以选择使用健胃、促进消化类药物进行治疗，缓解宝宝食欲差、吃不下饭的临床症状。

其次，要注意少食多餐，防止因为吃得太多造成肠胃负担，导致宝宝食欲差的临床症状。同时，给宝宝母乳喂养时，妈妈的饮食应以清淡为主。如果是奶粉喂养，则需要将水的含量增多。

另外，还可以给宝宝进行腹部按摩和热敷，来缓解宝宝食欲差的临床症状。

三个月宝宝食欲差，主要是因为肠胃功能不成熟，容易引发炎症或者感染。必要时，应及时前往医院进行检查，并积极配合医生治疗。