龋齿治疗后疼痛的原因有很多种，龋齿包括浅龋、中龋、深龋。

浅龋没有主观症状，病变只局限于釉质层，这种龋齿只有简单充填就可以了。中龋病变在牙本质的浅层，需要去净龋坏组织并做单层垫底充填。深龋病变已经发展到牙本质的中层和深层，需要去净龋坏组织并且做双层垫底充填。

龋齿治疗后牙齿疼痛，可能是由于龋坏组织接近牙髓，过于敏感，没有垫底导致。也可能是由于一开始牙髓状态判断不正确导致，龋坏已经发展到了牙髓，通过完善的根管治疗才能达到治愈的目的。