肚脐眼流脓是不能自愈的。

肚脐眼流脓，说明局部受到感染比较严重，有可能平时经常挖肚脐，或者肚脐进水没有擦干净，受到感染引发。倘若不及时治疗，有可能会造成脓肿越来越大，扩散到周围的组织。需要尽快应用双氧水将脓液清理干净，必要时局部填塞引流纱条，促进引流通畅，再给予消炎的药膏涂抹在表面，口服或静脉点滴抗生素抗炎治疗，控制炎症，做好局部的换药，才能促进伤口逐渐修复愈合。

总之，肚脐眼流脓是不能自愈的，需要给予抗炎治疗。