葡萄球菌感染可以发生于身体各个部位，而痤疮杆菌感染最常见于皮肤、皮脂腺感染，偶尔可以通过皮肤破口进入人体内，发生各种导管或是心脏瓣膜感染。

葡萄球菌感染往往会引起各组织器官的化脓性感染，例如小叶性肺炎、皮肤疖和痈等治疗时，常常首选青霉素。部分葡萄球菌皮肤感染可以先进行切开引流等外科治疗，再用药。

而痤疮杆菌最常引起的疾病是痤疮，治疗时首选的抗生素是红霉素以及头孢菌素等吗，一般仅为皮肤局部感染可以局部用药。如果发生心内膜炎、脑膜炎等则需要全身用药，缓解患者的症状。