子宫内有囊肿，可能的原因有：

1.生理性原因导致。在女性的生长发育过程中，可能由于某些因素导致子宫有横隔或纵隔，导致女性每次月经不能完全排干净，逐渐形成经血的淤积，呈液性囊状暗区。超声检查的时候，就可以看到子宫内有类似囊肿的声像，这类女性大多数会有痛经的表现。有些女性子宫内膜增厚形成膜状月经，在超声检查的时候也可以检查出子宫内有囊肿，这种情况一般月经后复查的时候囊肿就可以消失。这里表述的子宫内有囊肿，也可能是宫颈的纳氏囊肿。

2.妇科炎症导致。比如子宫内膜炎症、子宫肌瘤囊性变等。建议女性如果出现子宫内有囊肿，一定要去正规的医院，让医生做出正确判断，避免延误病情。