月经第5天有褐色分泌物，是因为整个月经周期月经的量以及颜色会有所变化。月经快结束，宫腔内残留有一些子宫内膜没有及时排出形成褐色的分泌物。

女性的月经来潮第一天会有褐色的分泌物，月经来潮第2到第3天，量比较多，颜色暗红。到了第5到第7天，月经量减少，月经颜色变得比较暗。

如果整个月经周期都是褐色的分泌物，可能是怀孕引起的先兆流产。有些女性误以为是来月经，也可能是月经失调有关，需要做相关检查了解一下其原因。