隐孢子虫病的患者经过规范的治疗之后完全可以治愈。

目前在临床上治疗隐孢子虫病尚没有特效药物，通常采用阿奇霉素、克林霉素、螺旋霉素、大蒜素等药物进行对症治疗。如果患者病情比较轻应用口服补液就可以，如果病情比较严重的患者会频繁腹泻从而引发水电解质紊乱，要立即给予补液纠正。

如果是免疫力下降、低蛋白血症、营养不良的患者要采取营养支持的治疗，最大程度的恢复患者的免疫功能。同时患者要多喝温开水，注意饮食卫生，避免食用不容易消化的食物。