鼻孔里面有两个红色的肉球，可以根据病因通过下列几种方式来处理：

1.因急性的鼻炎或者是鼻窦炎等疾病，造成的鼻孔内的鼻甲红肿或者是肥大引发的红色肉球，可以通过服用抗病毒或者是抗生素等药物，配合鼻腔内使用的减充血剂类药物进行缓解和治疗。上述药物使用之后，鼻腔内黏膜以及鼻甲等的肥大、充血表现通常都会明显地好转。急性鼻炎或鼻窦炎病情痊愈后，肥大的鼻甲也会恢复正常。

2.如果是长时间的慢性鼻炎，造成了鼻甲不可逆转性的肥大，导致鼻孔内的红色肉球长时间地堵塞鼻道，影响了患者正常的日常呼吸，这种情况就需要通过等离子消融手术等方式进行部分的切除处理。