肛瘘的形成一般考虑可能是由于肛腺感染以后造成肛门内部形成脓肿，脓肿破溃以后造成与外界相通的管道。

一般可以分为三部分，原发内口、瘘管和外口，引起反复的流脓、流水等情况，一般是由于内口感染以后造成局部引起感染，通过瘘管造成外部引起的感染反应。

同时肛瘘也分为很多种，最常见的主要是低位肛瘘，复杂性肛瘘和高位肛瘘，主要是根据瘘管的位置等情况决定是什么类型的。高位肛瘘一般治疗需要通过手术的方式处理，手术中需要彻底的清除瘘道、处理内口，防止发生复发等情况。