真菌性甲沟炎主要是根据病情的轻重等情况决定的，治疗的时间长短也有所不同。需要先到医院明确诊断，就诊外科，同时检查一下药敏和细菌培养。

真菌性甲沟炎病原菌主要为红色毛癣菌，也可由须癣毛癣菌、表皮癣菌及小孢子菌引起。

治疗以外用药为主，可选用各种抗真菌药，如咪康唑霜、益康唑霜、联苯苄唑霜、环吡酮胺等。涂抹药时一般超出可见皮损范围的2～3厘米，因为皮损边缘的“正常”皮肤可能已经被真菌感染。治疗一般需2周左右症状消失后，即使患处皮肤看来已恢复正常，也要继续坚持用药，外用药不少于2周。