支原体感染多是因为肺炎支原体感染引起的呼吸道和肺部的炎症改变。常同时伴有咽炎、支气管炎和肺炎，如为支原体肺炎感染，应首选大环内酯类抗生素。早期使用抗生素，可以减轻症状和缩短病程。

本病具有自限性，多数病例不经治疗可治愈，疗程一般为2到3周。因支原体没有细胞壁，所以对青霉素或头孢类等抗生素无效果。同时应予以对症治疗，如伴有剧烈呛咳可采取镇咳药。如合并细菌感染，应根据病原学检查，选用针对性的抗生素治疗。