造成扁桃体角化症疾病出现的病因，主要有下列几类：

1.全身性的疾病。例如本身患有糖尿病、甲状腺功能亢进或者是减退等各种类型疾病的患者，有可能会因为疾病的影响或者是日常饮食减退，导致出现扁桃体部位上皮组织营养不良的情况。此时，扁桃体就会出现局部角化症状。

2.患有慢性扁桃体炎。尤其是慢性扁桃体炎频繁发作的患者，也容易诱发局部角化。

3.扁桃体部位如果长时间地存在口颊纤毛菌等真菌感染，也有可能会引发此类疾病出现。