眼睛局部及全身的炎症会引起眼底的病变。例如各种葡萄膜炎，引起视网膜炎、结核、梅毒等感染会导致视网膜及脉络膜的炎症。眼部及头颅的外伤，可以导致眼底疾病，例如眼球挫伤、视网膜视神经挫伤。

全身系统性疾病也会导致眼底病变，例如糖尿病、高血压会引起糖尿病性视网膜病变、高血压性视网膜病变。全身的恶性肿瘤可以转移到葡萄膜、视网膜。

眼底的先天性遗传性疾病也会产生眼底病变，例如家族性渗出性玻璃体视网膜病变、原发性视网膜色素变性等等。眼睛局部的病理生理性改变，也会引起眼底疾病，例如玻璃体后脱离会导致视网膜裂孔、视网膜脱离等。