毛孢子菌病在临床上主要与隐球菌感染相鉴别，本病在培养的结果出来之前，可以进行血清学的评估。

毛孢子菌能够和新生隐球菌多糖产生一种交叉抗原，当毛孢子菌侵犯中枢神经系统并且造成感染时，新生的隐球菌抗原可出现阳性表现，所以如果怀疑得了毛孢子菌病，隐球菌的抗原检查也对其诊断有所帮助。

患者感染毛孢子菌病之后，常出现的临床症状主要有心悸、恶心、呕吐、头痛以及结节。治疗本病可以首先将毛发剔除，然后使用抗真菌剂进行治疗，比如6%的水杨酸、12%的甲丙酸、3%的硫磺等，就可以将本病治愈。