睾丸囊肿的治疗方法与囊肿的大小，以及有无临床症状等因素有一定关系。

如果睾丸囊肿的直径较小，没有引起明显的临床症状，一般先不进行治疗，应当定期去医院进行复查，了解囊肿是否存在增大的迹象。

如果囊肿直径较大，引起明显的疼痛、坠胀等不适症状，可以进行手术治疗。如果仅仅是单纯的囊肿，周围没有出现病变，可以进行囊肿剜除术，在术后大多数患者预后较好。

如果囊肿比较严重，比如睾丸的实质完全被囊肿所代替或者是伴有恶性的癌变，在必要时应当进行睾丸切除术。