先天性心脏病的侧切手术费用，还要根据切除的部位来决定。先天性心脏病侧切手术，大多适用于房间隔缺损、动脉导管未闭和室间隔缺损。

房间隔缺损侧切的费用为3万到4万元不等，室间隔缺损侧切的费用在4万到5万元左右，而动脉导管未闭的侧切费用在2万元左右。这些费用还不包含检查费、术后的药费。

当然，由于地区差别和医院的级别不同，以及应用的手术设备不同，侧切手术的费用也是不等的。具体的还需去当地专科医院去咨询之后，才能做到心中有数。通过侧切的手术，可以达到以上先天性疾病的根治的目的。