脑脊液鼻漏第一个引起的并发症:脑膜炎。脑脊液鼻漏最可怕的并发症就是脑膜炎，见于5%到30%的患者，耳漏者为7.6%，在鼻漏者达25%。其中骨折线1厘米者感染率为38%，而在非创伤性脑脊液漏并发脑膜炎者可以达到26%到60%。

若脑脊液鼻漏超过7天，脑膜炎的发生率可以高达88%。一旦发生脑膜炎后有很高的死亡率，耳漏者为1.5%，鼻漏者可以达到10%。因此如果患者有不明原因的脑膜炎发生且发作不止一次，就要高度的怀疑是否有脑脊液漏。

一旦发生脑膜炎必须正确使用抗生素并在脑膜炎治愈后施行脑脊液漏修补术，防止再次脑脊液漏或者脑膜炎的复发。脑脊液漏第二个并发症就是低压性的头痛。由于脑脊液流失，病人可以表现为非常典型的低张力性头痛。头痛在站立位时加重，仰卧位时缓解。

脑脊液鼻漏还可以引起颅内的积气，而颅内积气使得脑脊液进一步的外流，进入颅内的气体又进一步的增多，这种情况多见于严重的脑外伤及颅底骨折的患者。