持续39℃高烧，如果没有及时采取降温治疗，24小时之内就有可能会引起严重的并发症，比如胃部烧灼感、腹痛、恶心、呕吐、腹泻等症状。

此外，还有可能会引起高热惊厥。还会因体内丢失大量水分而引起电解质紊乱、脱水，甚至还有可能会出现晕厥。

除此之外，持续高烧39℃，有可能会使中枢神经系统受到不可逆损害，而这种危险甚至能在数分钟或者几十分钟内就可以出现。尤其是出现脑膜炎之后，若超过3天体温仍未控制，则有可能会导致感染性休克，甚至还会引起死亡的严重后果。