第一首先需要配制灌肠的药物。灌肠的方药需要根据患者不同的病情特点，配制经过煎煮后浓缩至一定的剂量。也可以选择已经做成成品的药物，如溃疡性结肠炎可以选用康复新液或复方黄柏液。

第二使用方法。先在肛周和灌肠管涂少许石蜡油，使之润滑，以便在插入时不至于对肛门及粘膜产生刺激和损伤，然后将灌肠管插入肛门，其插入的深度需要根据患者所患的疾病来确定，然后将已经配制好的药液，经过灌肠管滴入。

该操作有一定的风险，所以建议在医务人员的指导下操作。