食管疾病应该要就诊于医院的消化内科或者是普通外科。

如果怀疑患者有食管疾病，比如反流性食管炎，并且只是出现反酸、烧心等症状，想通过保守治疗的方式缓解时，到医院的消化内科就诊。

怀疑患者的食管疾病较为严重，可能有食管癌或者食管狭窄，通过保守治疗的方式症状未能改善，需要手术治疗时，有可能需要到医院的普通外科就诊。加上每个医院科室设置不同，可能需要就诊的科室也会有所不同。

如果明确有食管癌，而且医院设置有肿瘤科，也可以到医院的肿瘤科就诊。