治疗新生儿单纯疱疹病毒感染首先要做好隔离防护工作，以免患儿遭受其它病毒入侵，致使病情严重、增加治疗难度；其次给患儿注射阿昔洛韦、阿糖腺苷等药剂来抑制病毒繁殖、避免全身感染；最后根据患儿的具体病情开展局部对症用药，如用生理盐水湿敷水疱或红肿处，

用龙胆紫药液涂抹疱疹溃烂处等。注：家长做好密切关注新生儿体征变化、让新生儿保持充足的睡眠时间和干净的个人卫生等等全面悉心的护理照顾工作有利于巩固新生儿单纯疱疹病毒感染的治疗效果，使其真正恢复健康。