宝宝甲流病毒多久会自愈，需要根据是否有其他并发症等综合因素来进行分析。

如果宝宝甲流病毒感染以后没有其他并发症出现的情况下，一般1~2周后会自愈，并且患儿预后良好。但是如果合并其他并发症的情况下，比如支气管炎、肺炎、心力衰竭等，一般是不能够自愈的，还需要积极的进行治疗，具体痊愈的时间是不确定的，差异比较大。

当患儿感染甲流病毒以后需要多喝水，密切观察患儿的病情变化。如果出现症状比较严重时，需要及时就医进行治疗，家长要做好防范以及观察工作。