甲功三项检查可以查出甲状腺功能亢进症，在甲状腺功能亢进症时游离T3、游离T4升高，促甲状腺激素水平下降。同时，甲功三项还能查出甲状腺功能减退症，甲减时游离T3、游离T4水平下降，促甲状腺激素水平升高，这在原发性甲状腺功能减退症时出现这种情况。

如果下丘脑垂体出现甲状腺功能减退症的情况，也就是出现继发性甲状腺功能减退症，这时促甲状腺激素、甲状腺激素，包括游离T3、游离T4均呈下降的趋势。

同理，如果是在继发性甲状腺功能亢进症，促甲状腺激素、甲状腺激素，包括游离T3、游离T4都是升高。查甲功三项，一般都是查游离T3、游离T4和调节甲状腺激素的促甲状腺激素。