痢疾志贺菌的致病物质有菌毛、内毒素、外毒素。

1.菌毛。通过粘附在回肠末端和结肠黏膜的上皮表面，再进入上皮细胞内，通常在黏膜固有层内进行繁殖，形成感染灶。

2.志贺菌有强烈的内毒素。内毒素使肠壁的通透性增高，促进内毒素的吸收，从而引起患者体温升高、神志不清，严重者可以出现中毒性休克。另外内毒素还能破坏黏膜，导致炎症、溃疡、脓血便、黏液便等典型症状。并且内毒素还可作用于肠壁的神经，造成肠道功能紊乱、蠕动失调、痉挛，尤其是直肠括约肌痉挛，使患者出现里急后重等症状。

3.外毒素。其分别具有三种活性，神经毒性、细胞毒性和肠毒性。