咽拭子检测不会导致交叉感染。

首先，需要明确交叉感染的定义及条件，是指病人之间发生的相互感染，可由消毒不完善所致，也就是在咽拭子检测中若是医务人员未及时手消、戴手套亦或是使用同一棉棒采样时等才可导致交叉感染。

但是，这一点是无需过度担心的，医务人员是全程佩戴好手套的，若由于物资相对缺乏时，亦是保证做任何一项操作之前，医务人员都是严格经过手消毒的；至于重复使用同一棉棒采样更是不可能发生，否则会严重影响检测准确性。因此，咽拭子检测不会导致交叉感染的出现。