急性附睾炎如果治疗及时，病损可以完全消退，而无损害。但附睾功能仍可能受到一定影响。如果治疗不及时或者治疗不当，炎症可以发展形成脓肿导致附睾组织严重损害。此外附睾炎可继发纤维化，导致附睾管道的狭窄或闭塞。双侧附睾都有损害时，可导致男性不育症和生育能力低下。累及睾丸时，还可以引起睾丸生精功能障碍。附睾的脓肿，可以延伸并破坏睾丸。一部分急性附睾炎，会演变成慢性的附睾炎。